O ile wszystkie poprzednie gry komputerowe tego rodzaju (wliczając w to pozostałe tytuły z serii Silent Hunter) zostały symulatorami okrętów podwodnych, to o grze Battle of the Atlantic tego samego powiedzieć się już nie da. Programiści z Ubisoft Romania zafundowali nam bowiem 1-szy w historii symulator kapitana okrętu podwodnego. Różnica pozornie niewielka, ale faktycznie stawia ona cała rozgrywkę na głowie, co wychodzi grze na dobre. Cała gra została podporządkowana tej idei. Wnętrze okrętu jest całkowicie trójwymiarowe i umożliwia na to, o czym fani marzyli od lat: na swobodne przechadzanie się po zypełnym pokładzie. Nie jest to wyłącznie efekt wizualny, tutaj omal wszystko wykonujemy z perspektywy kapitana. Aby wydać rozkaz, musimy wyszukać odpowiedniego członka załogi i ustnie poinformować go o naszych oczekiwaniach. Dokładnie tak samo z obsługą przyrządów, do każdego trzeba podejść i kliknąć na odpowiednie urządzenie. Także w trybie peryskopu komenderujemy, rozmawiając z oficerem.